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北大医院前身为北京医科专门学校附设诊察所，后陆续更名为北京医科大学校附属医院、北平大学医学院附属医院等。1946年，医院随北平大学医学院并入北京大学，由此得名“北大医院”。1952年，全国高等学校院系调整，北京大学医学院独立建院，设立北京医学院，后又更名为北京医科大学，医院随之先后更名为北京医学院附属医院、北京医学院第 一医院、北京医科大学第 一医院。2000年，北京大学与北京医科大学再次合并，医院随之更名为“北京大学第 一医院”。2008年，医院成为中央保健基地医院。
北大医院坚持以患者需求为导向，持续优化医疗服务。设有39个临床科室、12个医技科室，共有71个病区，开放床位2259张。2023年度，门、急诊量324万人次，出院患者11.2万人次，手术近4.6万余例，平均住院日5.4天。开展疑难危重患者的MDT诊疗，设有MDT团队53个，囊括肿瘤、心血管疾病、卒中、代谢疾病、重症、罕见病等各领域，年会诊疑难病历超过2000人次。
糖尿病是慢性肾脏病的重要危险因素。糖尿病患者中，有一定比例的患者终都可能进展到尿毒症，如何避免或者延缓这个进程是很多病友心存的疑惑。同时，寻医问药，总是有患者在治病过程中因为用药导致肾脏损伤，而随着医学技术不断改进，创新不断诞生，相关性肾损害也屡见出现。
北京大学第 一医院依托国家高水平医院临床研究和成果转化能力试点项目，搭建生物样本库、研究型病房、交叉研究平台、大数据AI平台等，形成基础研究、转化研究、临床研究为一体的创新平台。在2022年度中国医院医院科技量值（STEM）排行榜中位列第14位，其中1个学科排名全国第 一，6个学科排名前十、9个学科排名前二十。近五年来，获批国家、省部市、校级和横向课题，以及临床试验合计2300余项，经费约16亿元，其中纵向课题超9亿元。累计发表论文6000余篇，SCI（即《科学引文索引》）收录论文3000余篇，其中部分发表在包括《Nature》、《New Engl J Med》、《JAMA》、《BMJ》等国际期刊上。获国家、教育部、北京市、中华医学会等科技成果奖70项，其中国家及部委级奖项12项。